Vastaa Viestiin

Mon arbre généalogique contredit par mon test ADN ?

rrrrrrd
male
Viestit: 394
Oui, en fait, sur un PCA, les Basques sont souvent très excentrés. Il suffit de parcourir quelques kms géographique pour s'en éloigner rapidemment.
L'échantillon "south-West France", semble assez proche des Basques (peut-être même qu'il y a des basques dans cet échantillon).
Malheureusement, les échantillons ne sont pas toujours représentatif!
Marrant de voir cette récurrence de la Cantabrie, sachant qu'elle est de lignée mtdna H4a1 qui trouve sont origine dans ce coin
Si vous êtes intéressez par quelque chose plus fiable.
Lukasz Macuga a récolté des moyennes de beaucoup de régions Européennes et mondiales, pour le calculateurs Eurogenes K36.
En lui envoyant une contribution financière (7€), il vous enverra un document pdf, dont vous avez des exemples sur sa page.
http://www.lm-genetics.ovh/
Dans le même genre, mais en moins détaillé, (mais gratuit), cette page:
http://gen3553.pagesperso-orange.fr/ADN/similitude.htm
Merci Jérôme, je connaissais ces deux sites, le deuxième j'ai déjà fait le test, elle est à 7.62 % de Basque.
Et tout de même 4.74% de fennoscandian..
.

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jerome4 kirjoitti:
15 Kesäkuu 2018, 17:38
rrrrrrd kirjoitti:
15 Kesäkuu 2018, 13:54
Pour les calculateurs gedmatch, vous devriez essayer Eurogenes EUtest V2 K15.
Il y a un South-West France comme population de référence dans les Oracles qui devrait être iintéressant pour vous.
Normalement, il devrait sortir parmi les premières de vos populations les plus proches.
Attention Jérôme, si je me base aux résultats de ma grand mère 100% foie gras de canard :D
South-West France n'est finalement pas si évident sur ce calculateur.

2.jpg
Oui, en fait, sur un PCA, les Basques sont souvent très excentrés. Il suffit de parcourir quelques kms géographique pour s'en éloigner rapidemment.
L'échantillon "south-West France", semble assez proche des Basques (peut-être même qu'il y a des basques dans cet échantillon).
Malheureusement, les échantillons ne sont pas toujours représentatif!
L'échantillon "French" est assez spécial dans les oracles. Il y a des Franco-Allemand, des Suisses et même un Italien du Piedmont dedans.

Si vous êtes intéressez par quelque chose plus fiable.
Lukasz Macuga a récolté des moyennes de beaucoup de régions Européennes et mondiales, pour le calculateurs Eurogenes K36.
En lui envoyant une contribution financière (7€), il vous enverra un document pdf, dont vous avez des exemples sur sa page.
http://www.lm-genetics.ovh/

Dans le même genre, mais en moins détaillé, (mais gratuit), cette page:
http://gen3553.pagesperso-orange.fr/ADN/similitude.htm
Si je comprend bien il fait payer 7€ pour juste ne pas faire apparaitre les premières composantes d'une PCA (voir Plots & dendrogram) d'autant plus que la PCA, Analyse en Composante Principale ( méthode Française) n'est pas adaptée aux variables à valeur discrètes mais au variables continues. Il faut utiliser une AFC dans ce cas là (analyse Factorielle des Correspondances ou FCA en Anglais).

jerome4
male
Viestit: 6551
rrrrrrd kirjoitti:
15 Kesäkuu 2018, 18:20
Oui, en fait, sur un PCA, les Basques sont souvent très excentrés. Il suffit de parcourir quelques kms géographique pour s'en éloigner rapidemment.
L'échantillon "south-West France", semble assez proche des Basques (peut-être même qu'il y a des basques dans cet échantillon).
Malheureusement, les échantillons ne sont pas toujours représentatif!
Marrant de voir cette récurrence de la Cantabrie, sachant qu'elle est de lignée mtdna H4a1 qui trouve sont origine dans ce coin
Si vous êtes intéressez par quelque chose plus fiable.
Lukasz Macuga a récolté des moyennes de beaucoup de régions Européennes et mondiales, pour le calculateurs Eurogenes K36.
En lui envoyant une contribution financière (7€), il vous enverra un document pdf, dont vous avez des exemples sur sa page.
http://www.lm-genetics.ovh/
Dans le même genre, mais en moins détaillé, (mais gratuit), cette page:
http://gen3553.pagesperso-orange.fr/ADN/similitude.htm
Merci Jérôme, je connaissais ces deux sites, le deuxième j'ai déjà fait le test, elle est à 7.62 % de Basque.
Et tout de même 4.74% de fennoscandian..
.
Les valeurs des composants n'ont pas de véritable valeurs sans comparaison avec d'autre.
C'est pour cela qu'il faut faire des oracles ou des calculs de similitude..

jerome4
male
Viestit: 6551
mtersac kirjoitti:
15 Kesäkuu 2018, 19:17
jerome4 kirjoitti:
15 Kesäkuu 2018, 17:38
rrrrrrd kirjoitti:
15 Kesäkuu 2018, 13:54


Attention Jérôme, si je me base aux résultats de ma grand mère 100% foie gras de canard :D
South-West France n'est finalement pas si évident sur ce calculateur.

2.jpg
Oui, en fait, sur un PCA, les Basques sont souvent très excentrés. Il suffit de parcourir quelques kms géographique pour s'en éloigner rapidemment.
L'échantillon "south-West France", semble assez proche des Basques (peut-être même qu'il y a des basques dans cet échantillon).
Malheureusement, les échantillons ne sont pas toujours représentatif!
L'échantillon "French" est assez spécial dans les oracles. Il y a des Franco-Allemand, des Suisses et même un Italien du Piedmont dedans.

Si vous êtes intéressez par quelque chose plus fiable.
Lukasz Macuga a récolté des moyennes de beaucoup de régions Européennes et mondiales, pour le calculateurs Eurogenes K36.
En lui envoyant une contribution financière (7€), il vous enverra un document pdf, dont vous avez des exemples sur sa page.
http://www.lm-genetics.ovh/

Dans le même genre, mais en moins détaillé, (mais gratuit), cette page:
http://gen3553.pagesperso-orange.fr/ADN/similitude.htm
Si je comprend bien il fait payer 7€ pour juste ne pas faire apparaitre les premières composantes d'une PCA (voir Plots & dendrogram) d'autant plus que la PCA, Analyse en Composante Principale ( méthode Française) n'est pas adaptée aux variables à valeur discrètes mais au variables continues. Il faut utiliser une AFC dans ce cas là (analyse Factorielle des Correspondances ou FCA en Anglais).
Je ne connais pas les méthodes mathématiques...
Moi, lorsqu'une méthode fonctionne, c'est OK, lorsqu'elle ne fonctionne pas; c'est pas OK. :D

J'ai réalisé quelques PCA avec ma méthode toute simple: en appliquant des valeurs géographiques aux composants, cela donne un PCA plus réaliste que n'importe quel PCA (et je suis sûr aussi des FCA) générés par des logiciels spécialisés

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jerome4 kirjoitti:
15 Kesäkuu 2018, 20:17
Je ne connais pas les méthodes mathématiques...
Moi, lorsqu'une méthode fonctionne, c'est OK, lorsqu'elle ne fonctionne pas; c'est pas OK. :D

J'ai réalisé quelques PCA avec ma méthode toute simple: en appliquant des valeurs géographiques aux composants, cela donne un PCA plus réaliste que n'importe quel PCA (et je suis sûr aussi des FCA) générés par des logiciels spécialisés
Y plein de méthodes "qui marchent" (par Coluche) ces exemples sont donnés aux élèves et étudiants en statistique pour se méfier de la mauvaise interprétation d'une analyse : distinguer "causalité et corrélation"

« Quand on est malade, il ne faut surtout pas aller à l'hôpital : la probabilité de mourir dans un lit d'hôpital est 10 fois plus grande que dans son lit à la maison ».

Ou bien : « 1/3 des accidents de la route étant dus à des conducteurs alcooliques, qu'est ce qu'on attend pour punir les 2/3 de conducteurs sobres responsables de la majorité des accidents ? »...
Dans une analyse de données ACP ou AFC ou autre je ne connais que des individus (les populations) et des variables (les haplogroupes par exemple) Je ne comprend pas bien ce qu'est "l'application des valeurs géographiques au composants (sic)."
Vous voulez sans doute parler de l'interprétation d'une ACP (avec ses composantes) reportée sur une carte géographique je pense ?
Voir ici l'interprétation d'une étude de 30 stations le long du Doubs (individus) caractérisée par des variables physico-chimiques et leur report sur une carte :
https://fr.wikipedia.org/wiki/Analyse_en_composantes_principales#Exemple_sous_R
Dites moi si je me trompe ?
Amicalement

krystian63
male
Viestit: 8
Je profite (j'abuse ?) des compétences présentes pour demander une explication sur les résultat Eurogenes EUtest V2 K15 4-Ancestors Oracle. Quelle interpretation de la dernière partie " Using 4 populations approximation:"

Merci !!

Eurogenes EUtest V2 K15 4-Ancestors Oracle
This program is based on 4-Ancestors Oracle Version 0.96 by Alexandr Burnashev.
Questions about results should be sent to him at: Alexandr.Burnashev@gmail.com
Original concept proposed by Sergey Kozlov.
Many thanks to Alexandr for helping us get this web version developed.

Admix Results (sorted):

# Population Percent
1 Atlantic 39.23
2 West_Med 23.00
3 North_Sea 18.50
4 Baltic 9.09
5 East_Med 3.86
6 West_Asian 2.42
7 Red_Sea 2.11


Finished reading population data. 207 populations found.
15 components mode.

--------------------------------

Least-squares method.

Using 1 population approximation:
1 Southwest_French @ 7.502841
2 Spanish_Aragon @ 8.079606
3 French_Basque @ 8.607800
4 Spanish_Cantabria @ 9.281423
5 Spanish_Castilla_La_Mancha @ 9.957222
6 Spanish_Valencia @ 10.618416
7 Spanish_Castilla_Y_Leon @ 11.829267
8 Spanish_Andalucia @ 12.087076
9 Spanish_Cataluna @ 12.631336
10 Spanish_Murcia @ 13.499602
11 Spanish_Extremadura @ 14.295660
12 Portuguese @ 15.429750
13 Spanish_Galicia @ 16.782465
14 French @ 19.269289
15 North_Italian @ 20.665705
16 South_Dutch @ 22.252531
17 Southwest_English @ 24.245712
18 Southeast_English @ 25.409466
19 Irish @ 26.822536
20 Austrian @ 27.041441

Using 2 populations approximation:
1 50% French_Basque +50% Southwest_French @ 4.709990


Using 3 populations approximation:
1 50% French_Basque +25% Southwest_French +25% Spanish_Castilla_Y_Leon @ 4.317175


Using 4 populations approximation:
++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++
1 French_Basque + French_Basque + Southwest_French + Spanish_Castilla_Y_Leon @ 4.317175
2 French_Basque + French_Basque + Southwest_French + Spanish_Cataluna @ 4.647985
3 French_Basque + French_Basque + Southwest_French + Southwest_French @ 4.709990
4 French_Basque + French_Basque + Spanish_Castilla_Y_Leon + Spanish_Castilla_Y_Leon @ 4.720990
5 French_Basque + French_Basque + Spanish_Cantabria + Spanish_Castilla_Y_Leon @ 4.739989
6 French_Basque + French_Basque + Southwest_French + Spanish_Cantabria @ 4.818384
7 French_Basque + French_Basque + Spanish_Aragon + Spanish_Castilla_Y_Leon @ 4.833128
8 French_Basque + French_Basque + Southwest_French + Spanish_Aragon @ 4.957906
9 French_Basque + French_Basque + Southwest_French + Spanish_Valencia @ 4.962340
10 French_Basque + French_Basque + Spanish_Castilla_Y_Leon + Spanish_Cataluna @ 4.974907
11 French_Basque + French_Basque + Southwest_French + Spanish_Castilla_La_Mancha @ 4.992285
12 French_Basque + French_Basque + Southwest_French + Spanish_Galicia @ 4.994401
13 French_Basque + French_Basque + Portuguese + Southwest_French @ 5.005678
14 French_Basque + French_Basque + Spanish_Castilla_Y_Leon + Spanish_Valencia @ 5.019703
15 French_Basque + French_Basque + Southwest_French + Spanish_Murcia @ 5.039729
16 French_Basque + French_Basque + Spanish_Castilla_La_Mancha + Spanish_Castilla_Y_Leon @ 5.041716
17 French_Basque + French_Basque + Spanish_Cantabria + Spanish_Cataluna @ 5.042737
18 French + French_Basque + French_Basque + French_Basque @ 5.066000
19 French_Basque + French_Basque + French_Basque + Spanish_Galicia @ 5.072488
20 French_Basque + French_Basque + Southwest_French + Spanish_Extremadura @ 5.080266

Rekisteröimätön käyttäjä (mtersac)
avatar
krystian63 kirjoitti:
15 Kesäkuu 2018, 22:57
Je profite (j'abuse ?) des compétences présentes pour demander une explication sur les résultat Eurogenes EUtest V2 K15 4-Ancestors Oracle. Quelle interpretation de la dernière partie " Using 4 populations approximation:"
Merci !!
Je n'ai pas assez d'info et je ne suis pas un spécialiste des outils utilisés par ces laboratoires.
cai000040 sera sûrement plus compétant que moi pour vous donner une réponse.
La méthode des moindre carrés en en général utilisée pour ajuster une courbe sur une série de points
Voir ici : https://fr.wikipedia.org/wiki/M%C3%A9thode_des_moindres_carr%C3%A9s
Pour le reste je ne sais pas (manque d'élément). Je vois qu'ils additionnent des parties de populations ????
1 50% French_Basque +25% Southwest_French +25% Spanish_Castilla_Y_Leon
ça pourrait ressembler aux méthodes utilisées en analyse de donnée où on recherche une combinaison linéaire des variables destinée à extraire le maximum de variabilité ( mais là ce ne sont pas les variables mais les populations ?) pour créer une première composante explicative, puis dans le reste de la variabilité on réitère le processus pour faire une nouvelle combinaison linéaire des variables qui extrait le maximum de la variabilité restante dans une seconde composante qui soit orthogonale (c'est à dire indépendante) à la première puis on réitère ce processus ....troisième, quatrième etc...Composante...L'examen des graphique en 2 ou 3 dimension permet de mettre en évidence des structures qui sont parfois intéressantes (par exemple 2 populations ne se différencie QUE sur la 2 eme et 4 eme composante et on repère alors quelles sont les variables (haplogroupes) qui contribuent à ces deux composantes et qui différencient ces deux populations..(c'est une explication des méthodes utilisées en CPA et FCA mais je ne pense pas que ce soit ça dans vos données.
A vrai dire sur CES résultats je risque de vous dire des bêtises donc je laisse la place à des spécialistes de la "généalogie génétique"

krystian63
male
Viestit: 8
mtersac kirjoitti:
15 Kesäkuu 2018, 23:34
krystian63 kirjoitti:
15 Kesäkuu 2018, 22:57
Je profite (j'abuse ?) des compétences présentes pour demander une explication sur les résultat Eurogenes EUtest V2 K15 4-Ancestors Oracle. Quelle interpretation de la dernière partie " Using 4 populations approximation:"
Merci !!
Je n'ai pas assez d'info et je ne suis pas un spécialiste des outils utilisés par ces laboratoires.
cai000040 sera sûrement plus compétant que moi pour vous donner une réponse.
La méthode des moindre carrés en en général utilisée pour ajuster une courbe sur une série de points
Voir ici : https://fr.wikipedia.org/wiki/M%C3%A9thode_des_moindres_carr%C3%A9s
Pour le reste je ne sais pas (manque d'élément). Je vois qu'ils additionnent des parties de populations ????
1 50% French_Basque +25% Southwest_French +25% Spanish_Castilla_Y_Leon
ça pourrait ressembler aux méthodes utilisées en analyse de donnée où on recherche une combinaison linéaire des variables destinée à extraire le maximum de variabilité ( mais là ce ne sont pas les variables mais les populations ?) pour créer une première composante explicative, puis dans le reste de la variabilité on réitère le processus pour faire une nouvelle combinaison linéaire des variables qui extrait le maximum de la variabilité restante dans une seconde composante qui soit orthogonale (c'est à dire indépendante) à la première puis on réitère ce processus ....troisième, quatrième etc...Composante...L'examen des graphique en 2 ou 3 dimension permet de mettre en évidence des structures qui sont parfois intéressantes (par exemple 2 populations ne se différencie QUE sur la 2 eme et 4 eme composante et on repère alors quelles sont les variables (haplogroupes) qui contribuent à ces deux composantes et qui différencient ces deux populations..(c'est une explication des méthodes utilisées en CPA et FCA mais je ne pense pas que ce soit ça dans vos données.
A vrai dire sur CES résultats je risque de vous dire des bêtises donc je laisse la place à des spécialistes de la "généalogie génétique"
Merci en tout cas, c'est très gentil d'avoir pris le temps de cette réponse ! :-)

jerome4
male
Viestit: 6551
mtersac kirjoitti:
15 Kesäkuu 2018, 21:53
jerome4 kirjoitti:
15 Kesäkuu 2018, 20:17
Je ne connais pas les méthodes mathématiques...
Moi, lorsqu'une méthode fonctionne, c'est OK, lorsqu'elle ne fonctionne pas; c'est pas OK. :D

J'ai réalisé quelques PCA avec ma méthode toute simple: en appliquant des valeurs géographiques aux composants, cela donne un PCA plus réaliste que n'importe quel PCA (et je suis sûr aussi des FCA) générés par des logiciels spécialisés
Y plein de méthodes "qui marchent" (par Coluche) ces exemples sont donnés aux élèves et étudiants en statistique pour se méfier de la mauvaise interprétation d'une analyse : distinguer "causalité et corrélation"

« Quand on est malade, il ne faut surtout pas aller à l'hôpital : la probabilité de mourir dans un lit d'hôpital est 10 fois plus grande que dans son lit à la maison ».

Ou bien : « 1/3 des accidents de la route étant dus à des conducteurs alcooliques, qu'est ce qu'on attend pour punir les 2/3 de conducteurs sobres responsables de la majorité des accidents ? »...
Dans une analyse de données ACP ou AFC ou autre je ne connais que des individus (les populations) et des variables (les haplogroupes par exemple) Je ne comprend pas bien ce qu'est "l'application des valeurs géographiques au composants (sic)."
Vous voulez sans doute parler de l'interprétation d'une ACP (avec ses composantes) reportée sur une carte géographique je pense ?
Voir ici l'interprétation d'une étude de 30 stations le long du Doubs (individus) caractérisée par des variables physico-chimiques et leur report sur une carte :
https://fr.wikipedia.org/wiki/Analyse_en_composantes_principales#Exemple_sous_R
Dites moi si je me trompe ?
Amicalement
Ce que je veux dire , c'est que les composants sont déjà des composants géographiques (Iberian, Italian, Caucasian), donc ne pas en tenir compte serait dommage.

jerome4
male
Viestit: 6551
krystian63 kirjoitti:
15 Kesäkuu 2018, 22:57
Je profite (j'abuse ?) des compétences présentes pour demander une explication sur les résultat Eurogenes EUtest V2 K15 4-Ancestors Oracle. Quelle interpretation de la dernière partie " Using 4 populations approximation:"

Merci !!

Eurogenes EUtest V2 K15 4-Ancestors Oracle
This program is based on 4-Ancestors Oracle Version 0.96 by Alexandr Burnashev.
Questions about results should be sent to him at: Alexandr.Burnashev@gmail.com
Original concept proposed by Sergey Kozlov.
Many thanks to Alexandr for helping us get this web version developed.

Admix Results (sorted):

# Population Percent
1 Atlantic 39.23
2 West_Med 23.00
3 North_Sea 18.50
4 Baltic 9.09
5 East_Med 3.86
6 West_Asian 2.42
7 Red_Sea 2.11


Finished reading population data. 207 populations found.
15 components mode.

--------------------------------

Least-squares method.

Using 1 population approximation:
1 Southwest_French @ 7.502841
2 Spanish_Aragon @ 8.079606
3 French_Basque @ 8.607800
4 Spanish_Cantabria @ 9.281423
5 Spanish_Castilla_La_Mancha @ 9.957222
6 Spanish_Valencia @ 10.618416
7 Spanish_Castilla_Y_Leon @ 11.829267
8 Spanish_Andalucia @ 12.087076
9 Spanish_Cataluna @ 12.631336
10 Spanish_Murcia @ 13.499602
11 Spanish_Extremadura @ 14.295660
12 Portuguese @ 15.429750
13 Spanish_Galicia @ 16.782465
14 French @ 19.269289
15 North_Italian @ 20.665705
16 South_Dutch @ 22.252531
17 Southwest_English @ 24.245712
18 Southeast_English @ 25.409466
19 Irish @ 26.822536
20 Austrian @ 27.041441

Using 2 populations approximation:
1 50% French_Basque +50% Southwest_French @ 4.709990


Using 3 populations approximation:
1 50% French_Basque +25% Southwest_French +25% Spanish_Castilla_Y_Leon @ 4.317175


Using 4 populations approximation:
++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++
1 French_Basque + French_Basque + Southwest_French + Spanish_Castilla_Y_Leon @ 4.317175
2 French_Basque + French_Basque + Southwest_French + Spanish_Cataluna @ 4.647985
3 French_Basque + French_Basque + Southwest_French + Southwest_French @ 4.709990
4 French_Basque + French_Basque + Spanish_Castilla_Y_Leon + Spanish_Castilla_Y_Leon @ 4.720990
5 French_Basque + French_Basque + Spanish_Cantabria + Spanish_Castilla_Y_Leon @ 4.739989
6 French_Basque + French_Basque + Southwest_French + Spanish_Cantabria @ 4.818384
7 French_Basque + French_Basque + Spanish_Aragon + Spanish_Castilla_Y_Leon @ 4.833128
8 French_Basque + French_Basque + Southwest_French + Spanish_Aragon @ 4.957906
9 French_Basque + French_Basque + Southwest_French + Spanish_Valencia @ 4.962340
10 French_Basque + French_Basque + Spanish_Castilla_Y_Leon + Spanish_Cataluna @ 4.974907
11 French_Basque + French_Basque + Southwest_French + Spanish_Castilla_La_Mancha @ 4.992285
12 French_Basque + French_Basque + Southwest_French + Spanish_Galicia @ 4.994401
13 French_Basque + French_Basque + Portuguese + Southwest_French @ 5.005678
14 French_Basque + French_Basque + Spanish_Castilla_Y_Leon + Spanish_Valencia @ 5.019703
15 French_Basque + French_Basque + Southwest_French + Spanish_Murcia @ 5.039729
16 French_Basque + French_Basque + Spanish_Castilla_La_Mancha + Spanish_Castilla_Y_Leon @ 5.041716
17 French_Basque + French_Basque + Spanish_Cantabria + Spanish_Cataluna @ 5.042737
18 French + French_Basque + French_Basque + French_Basque @ 5.066000
19 French_Basque + French_Basque + French_Basque + Spanish_Galicia @ 5.072488
20 French_Basque + French_Basque + Southwest_French + Spanish_Extremadura @ 5.080266
Donc, vous voyez ici que vos résultats collent avec vos ancêtres.
La population la plus proche pour vous est SW_France
En deux populations, vous avez du French_Basque: donc on ne sort pas de cette zone.
Même en 4 populations, on reste dans le SW de l'Europe.
Cela dit, avec une distance de plus de 4, cela montre que le mélange proposé n'est pas optimal.
Si il y aurait plus d'échantillons au niveau régional, sans doute que le résultats pourrait être plus précis

J'ai vous ai mis sur cette carte (point rouge)
Vous êtes entre les Basques et l'échantillon South-West-France.
K.png
Viimeksi muokannut jerome4, 16 Kesäkuu 2018, 00:51. Yhteensä muokattu 1 kertaa.

Rekisteröimätön käyttäjä (mtersac)
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jerome4 kirjoitti:
16 Kesäkuu 2018, 00:36
Ce que je veux dire , c'est que les composants sont déjà des composants géographiques (Iberian, Italian, Caucasian), donc ne pas en tenir compte serait dommage.
Je n'ai surtout jamais dit ça ! sur ce point vous avez parfaitement raison.
On fait ces analyses et surtout on reporte la structure et l'information apportée sur une carte géographique (surtout lorsqu'on connait le lieu où vivait l'individu dont l'ADN a été prélevé. Pour ma part j'ajouterais une colonne à la matrice des individus donnant leurs coordonnées géographiques, (ce qui est sûrement fait)
C'est exactement comme pour l'exemple que je vous donnais à propos des "station du Doubs". Mais comme vous pouvez le voir sur cet exemple les deux figures centrales QUI SONT l'ACP ( 2 - les variables physico-chimiques et 3 - les individus (stations)) ne représente en rien la structure géographique du Doubs.
Elles apportent une information et sur les deux première composantes :
La composante 1 (maximum de variabilité) s'explique par des vecteurs (l'important est la direction des vecteurs et leur longueur par rapport aux autres vecteurs qui oppose sur la composante 1 l'oxygène (à gauche) et les polluants (a droite).
La composante 2 (verticale) est essentiellement mise en évidence par le pH.
Si on regarde maintenant la figure 3 des individus, l'analyse montre que les stations 25, 23, 24 sont les plus polluées. La station 15 a un pH élevé. Ensuite cette information est reportée sur la carte géographique (figure 4)
Remplacez maintenant les "stations du Doubs" par vos populations et les "variables physico-chimiques" par les haplogroupe et comme vous connaissez en plus la succession d'apparition de ces haplogroupes (que certains appellent la Timeline) vous obtenez les migrations.
Très amicalement

krystian63
male
Viestit: 8
Merci à tous de vos éclairages et du temps pris pour me répondre, j'ai beaucoup avancé grâce à vous, et surtout je n'ai pas à mettre mon arbre généalogique à la poubelle ! :)

pompouix
male
Viestit: 23
Sukupuu: Graafinen
Tarkastele heidän sukupuutaan.
Bonjour KRYSTIAN63

combien avez vous de pourcentage basque sur la calculateur K36 ?
car vous semblez tirer plus vers le Gascon que l' Auvergnat malgré tout !

Vastaa Viestiin

Palaa sivulle “Généalogie génétique”